自治区环保局是自治区人民政府主管全区环境保护工作的直属机构，主要职责是：

    1、贯彻执行国家环境保护的方针、政策、法律、法规，研究拟定自治区环境保护的政策及法规草案；协同有关部门制订与环境保护相关的经济、技术、资源配置和产业政策，组织对区内重大经济政策的环度影响评估。

    2、制定自治区环境保护规划和计划，参与制定自治区经济和社会发展中长期规划、年度计划、国土开发整治规划、区域经济开发规划、产业发展规划以及资源节约和综合利用规划；审核自治区地级市和重点县级市总体规划中的环境保护内容；管理全区环境统计扣环境信息工作，编报自治区环境质量报告书，发布自治区环境状况公报。

    3、监督自治区内实施环境保护国家标准（环境质量标准、污染物排放标准、环境基础标准、环境方法标准、标准样品标准）及环境保护行业标准，制定环境保护地方标准（环境质量标准、污染物排放标准）并监督。

    4、负责自治区的大气、水体、土壤等环境保护工作；负责监督管理全区的废气、废水、废渣、粉尘、恶臭气体、放射性物质、有毒化学品以及噪声、振动、电磁波辐射等污染防治工作；监督、管理国家禁止（或严格限制）建设的重污染项目名录和有责化学品优先控制名录；受自治区人民政府委托，处理涉及邻省、区的环境污染纠纷，协调区内跨地区间的污染纠纷，对重大环境污染事故和生态破坏事件进行调查处理。

    5、负责监督管理自治区自然保护工作；负责全区自然保护区的区划、规划工作；向自治区人民政府提出新建自治区级自然保护区审批建议；综合协调并监督检查自治区内生吻多样性保护与纽生动植物、珍稀濒危物种保护工作；指导生态农业建设；监督对区内生态环境有影响的资源开发活动。

    6、组织全区的排污申报登记与排污许可证、排污收费、环境影响评价、“三同时”等环境管理制度的实施；审批自治区限额内一切建设项目、技术改造项目和区域开发建设项目的环境影响报告书；指导全区城市环境综合整治工作，并负责全区城市环境综合整治定量考核工作；负责全区环境目标责任制的组织协调工作。

    7、执行国家环境保护技术政策，制定并组织实施自治区环保科技发展规划，环境保护产业发展规划；组织全区重大环境科技研究及环境科技合作；组织全区环境保护设备的质量监督、认证工作。

    8、管理全区环境监测工作，监督执行环境监测制度，管理区内国家级环境监测网络站，会同有关部门组织区内环境监测网络；指导环境监测站的计量认证和质量保证工作。

    9、指导协调全区的环境保护宣传教育工作；协同有关部门在大、中、小学和成人教育、干部涪训中开展环境教育和面向社会开展环镜宣传教育工作。

    10、指导全区环境保护队伍建设、规划与组织指导全区环境保护系统在职人员岗位培训和继续教育。

    11、配合有关部门做好自治区环境保护方面的外事工作，组织区内有关国际环境履约活动，组级协调环境保护项目利用外资工作。

    12、承担自治区人民政府环境保护委员会的具体工作。

    13、承办自治区人民政府交办的其他事项。